Próchnica jest głównym schorzeniem klinicznym rozpoznawanym w jamie ustnej. Powoduje ją mikrobiom, którego skład ulega ciągłej modulacji – ze względu na środki chemiczne, środowiskowe oraz skład śliny i dietę pacjenta. Choć podłoże próchnicy jest bakteryjne, nie jest ona uznawana za schorzenie natury zakaźnej z klasycznego punktu widzenia, ale wynikające ze skomplikowanych interakcji mikroorganizmów, podatności gospodarza lub opisanych powyżej czynników środowiskowych.