Afty nawracające są uciążliwym schorzeniem, powodującym dyskomfort i ból w jamie ustnej. W leczeniu pacjentów z tą jednostką chorobową bardzo ważne jest przeprowadzenie dokładnej diagnostyki i zadbanie o usunięcie stanów zapalnych w jamie ustnej oraz o stosowanie odpowiedniej higieny przez pacjenta. Ponadto wykorzystuje się także środki o działaniu miejscowym, takie jak glikokortykosteroidy (GKS), roztwory chloroheksydyny bądź tetracykliny.