Naczelna Rada Lekarska podjęła decyzję o wystąpieniu do Trybunału Konstytucyjnego z odpowiednim wnioskiem. W ocenie samorządu różnicowanie wysokości zasadniczego wynagrodzenia miesięcznego lekarzy i lekarzy dentystów odbywających specjalizację w ramach rezydentury w zależności od postępowania, w którym lekarz został zakwalifikowany do odbywania specjalizacji, jest niezgodne z art. 32 ust. 1 Konstytucji RP i art. 18 § 1 i art. 18 § 3 Kodeksu pracy.
Wysokość wynagrodzenia rezydentów kształtuje się odrębnie w zależności od postępowania, w którym lekarz został zakwalifikowany do odbywania specjalizacji. NRL wskazuje, że w wielu specjalizacjach będzie tak, że niższe wynagrodzenie otrzymają rezydenci, który zostali zakwalifikowani do odbywania specjalizacji w pierwszym postępowaniu kwalifikacyjnym przeprowadzonym w 2017 r. oraz we wcześniejszych postępowaniach kwalifikacyjnych. Z kolei rezydenci, którzy zostali zakwalifikowani do odbywania specjalizacji w drugim postępowaniu w roku 2017 i w późniejszych, będą otrzymywali wyższe wynagrodzenie, i to nawet o blisko 20 proc.
Naczelna Rada Lekarska uznała, że rozporządzenie bezzasadnie różnicuje podmioty, które powinny być traktowane równo wobec prawa. Ponadto w rozporządzeniu rozróżniono wysokość wynagrodzenia przyznanego lekarzom rezydentom w zależności od tego, w którym postępowaniu kwalifikacyjnym przyjęto ich na specjalizację, co oznacza, iż na mocy tej regulacji podzielono lekarzy i lekarzy dentystów – rezydentów na grupy lepiej oraz gorzej potraktowane. Zróżnicowanie wprowadzone w kwestionowanym dokumencie jest nie tylko nieuzasadnione, ale również ma nieproporcjonalny charakter.